当我热情地向大家推荐BioXM2.6的时候,他们扔给了我这个!

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1 、数据库保存和搜索

相比于2.6版本,2.7版本将序列框扩展到了9个,方便多序列比对,尤其适用于目的基因有多个剪接体的情况。此外,2.6版本左侧的四个快捷键变成了数据库索引框。当我们把序列粘贴进入序列框的时候,可以点击右下角的“序列保存至数据库”,并进行命名,就可以把这个序列保存在这个软件中。

比如当你做了点突变,测序数据返回的时候,直接从数据库里调用基因序列进行比对,省去了翻找序列的麻烦。

当你数据库中储存了大量序列而你有没有好好命名的时候,就要用到软件提供的搜索功能了。软件提供了模糊匹配和精确匹配,并且提供了序列名称、编号、注释等多种搜索方法,方便你快速查找自己需要的序列。

2 、丰富的收藏夹

如果你有收藏数据库和小神器的习惯,你的收藏夹肯定堆满了各种你觉得不错的网站,但是又因为长期不用,渐渐忘记了这些网站是干什么用的了。2.7 版的BioxM 软件贴心的为大家进行了分类,只需要轻轻一点,就可以直达你想要到达的数据库。

作者在2.6 版本的基础上进行了链接更新,我挑了几个常用数据库试了一下,基本都可以打开,而且很多网站我都是第一次才知道,有了这个软件,省得进行分类收藏了。

收藏夹包含了,GO分析、Pathway分析、蛋白结构预测等常用网站,还有转录因子结合位点分析等实用网站,大家可以多多尝试。

作者删除了四个快捷按钮,将更多的快捷键放在了软件最上方。这个软件用下来,发现2.7 版比2.6 版有了更多个性化的地方。比如序列比对输出的时候,以前只能用黑色,现在可以自选颜色。现在提供了多个Fasta 文件共同上传,自我搭建个性化序列数据库等。

当然大部分功能还是保持着2.6版的原汁原味,各位同学可以根据情况进行选择。希望今天的分享能够对你有用。

科研小助手 官方QQ群 :93646661转载、投稿、商务合作amateur_1988

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